Buku Populer
- The Tao of Islam
- Theresa
- Islam, Kekuasaan Pemerintahan, Doktrin Iman & Realitas Sosial
- Tarbiyah Cinta Imam Al-Ghazali
- Ingin Tahu Sejarah Seksualitas
- Malam Bencana 1965 Dalam Belitan Krisis Nasional (Buku ke-3)
- Malaikat Lereng Tidar
- Rasputin’s Daughter
- Bidadari Stories
- The End of History and the Last Man
- Sukarno: A Political Biography
- Sejarah Qiraat Al-Quran di Nusantara
- Skeptisisme dan Kebebasan
- Ponzi Ekonomi
- The Negotiator
- Panggil Aku Kartini Saja
- Melawan Skularisme
- Kunang-Kunang Kebenaran di Langit Malam
- Gerakan & Pemikiran Islam Indonesia Kontemporer
- Trio Musketri
- Serdadu Belanda di Indonesia 1945-1950
- Menegakkan Syariat Islam dalam Konteks Keindonesiaan
- Islam Liberalisme Demokrasi
- Arkeologi Sejarah Pemikiran Arab Islam 2
- Islam Subtantif